这个问题见了好几次,在.net下 Microsoft visual 2005->visual studio tools->visual studio 2005命令提示下输入aspnet_regiis -r,就可以只是重新注册一下而已这是因为你先装了.net而后装了iis用户的权限没加进运引起我的就是这种情况，先安装了.net环境，然后才安装 了IIS。
解决方案汇总：
第一
故障描述：服务器应用程序不可用
您试图在此 Web 服务器上访问的 Web 应用程序当前不可用。请点击 Web 浏览器中的“刷新”按钮重试您的请求。
管理员注意事项: 详述此特定请求失败原因的错误信息可在 Web 服务器的系统事件日志中找到。请检查此日志项以查明导致该错误发生的原因。
解决过程：
微软Framework1.1 SP1 安全更新程序 (KB886903)补定可能会导致web应用程序“服务器应用程序不可用”和“aspnet_wp.exe 意外停止”
cowbird
2005.02.15
很恼火，突然发现IIS中的应用程序不能浏览页面了，试了试任何一个aspx页面也打不开。重新用vs.net建立了个新的web应用程序，现象依旧。
电脑环境：
win2003,vs.net2003
问题现象：
1）当想浏览某个页面的时，会显示"服务器应用程序不可用" 您试图在此 Web 服务器上访问的 Web 应用程序当前不可用。请点击 Web 浏览器中的“刷新”按钮重试您的请求。 管理员注意事项:详述此特定请求失败原因的错误信息可在 Web 服务器的系统事件日志中找到。
到日志去一查，发现：“aspnet_wp.exe (PID: 356)意外停止。”
2）如果选择调试，显示如下图：
尝试：
想了想，问题是突然出现的，其间没有安装什么软件，也没有中病毒，奇怪了。
若根据"ExecutionEngineException"在google上查来的结果是“无药可救”，做好“最坏打算”，重装！。：）
根据“aspnet_wp.exe (PID: 356)意外停止”在google上查了查，发现网上的解决方法也无非是重新装IIS，重新装系统，重新装framework或者vs.net。
既然这样，先选择最简单的IIS重装，发现问题依旧。
接下来选择修复安装win2003，安装结束后，发现问题解决了。
大家都知道修复安装后的操作系统，补丁都会没有了。我就在一个个把补丁update，全部update好了以后，再运行，问题又出现。
原因定位：
显而易见，问题的原因就是补丁。不断的尝试，定位到Microsoft .NET Framework 版本 1.1 Service Pack 1 安全更新程序 (KB886903)把它删除后，问题解决。郁闷啊！花了我一整天时间，强烈要求微软“赔偿”。再网上一查，发现老外也遇到过同样这个问题http://www.mcse.ms/message1412685.html，也同样待解决。
第二
文框架下出现：
服务器应用程序不可用
您试图在此 Web 服务器上访问的 Web 应用程序当前不可用。请点击 Web 浏览器中的“刷新”按钮重试您的请求。
管理员注意事项: 详述此特定请求失败原因的错误信息可在 Web 服务器的系统事件日志中找到。请检查此日志项以查明导致该错误发生的原因。
英文框架下出现：
Server Application Unavailable
The web application you are attempting to access on this web server is currently unavailable. Please hit the "Refresh" button in your web browser to retry your request.
Administrator Note: An error message detailing the cause of this specific request failure can be found in the application event log of the web server. Please review this log entry to discover what caused this error to occur.
搜索了网上的大量资料，该问题比较经典，出现错误也很多，但国内与国外的网站与论坛上却没有比较完善的解决方法。经过一番摸索与尝试，终于有了比较好的解决方法。有三，如下：
1.重新开一个应用程序池，然后为这个目录单独指定这个池
2.访问权限的设置问题
3.重新装iis,再装framework
我的问题是属于第二个，访问权限的问题。做如下设置即可解决该问题：
在该web sites的virtual directory下,将Permissions设置一下,里面应包含
ASP.NET
IIs_WPG
Internet来宾帐户
System
而且ASP.NET权限要设置为 write & read.
设置后,一切运行正常。
第三
服务器应用程序不可用
您试图在此Web服务器上访问的Web应用程序当前不可用。请点击Web浏览器中的“刷新”按钮重试您的请求。
管理员注意事项:详述此特定请求失败原因的错误信息可在Web服务器的系统事件日志中找到。请检查此日志项以查明导致该错误发生的原因。
情况是这样的，我机器装有.NETFramework1.1和2.0，首先是我打开的2.0程序出现这个错误，发现这个错误以后，我打1.1的程序也不能运行。我选择了最传统的办法，重新启动我的系统。结果问题还是那样没有什么改变，只好重装我的IIS了，把1.1和2.0两个框架都配置好，结果是2.0的程序可以运行，1.1的程序还是那个错误。
没有办法，上网看看有没有什么相关的资料，看到了这篇文章：
http://www.cnblogs.com/cowbird/archive/2005/02/16/104546.html
但是我想问题不可能是那个样子，想来想去，想到了查看应用程序日志：改下一虚拟目录的应用程序池.让ASP.NET1.1和ASP.NET2.0的虚拟目录使用不同的应用程序池.
结果问题解决，好了搞定！
楼上是高手，确实是应用程序池的问题，给ASP.NET2.0的站点用新的池问题就解决了。
新建应用程序池的步骤
1.单击“开始”，指向“程序”，然后单击“控制面板”。
2.双击“管理工具”，然后双击“Internet信息服务(IIS)”。
3.右键单击“应用程序池”，指向“新建”，然后单击“应用程序池”。
4.在“应用程序池ID”文本框中键入AppPool1。
5.单击“确定”。
将应用程序分配到应用程序池
1.单击“开始”，指向“程序”，然后单击“控制面板”。
2.双击“管理工具”，然后双击“Internet信息服务(IIS)”。
3.双击“Web站点”。
4.双击“默认Web站点”。
5.右键单击“DebugApp1”，然后单击“属性”。
6.在“主目录”标签中的“应用程序池”列表框中选择“AppPool1”，然后单击“确定”。还有最重要的一点是设置应用程序池-->属性-->标识-->预定义帐户为本地系统
第四
故障描述：服务器应用程序不可用
您试图在此 Web 服务器上访问的 Web 应用程序当前不可用。请点击 Web 浏览器中的“刷新”按钮重试您的请求。
这个问题见了好几次,在.net下 Microsoft visual 2005->visual studio tools->visual studio 2005命令提示下输入aspnet_regiis -r,就可以只是重新注册一下而已这是因为你先装了.net而后装了iis用户的权限没加进运引起我的就是这种情况，先安装了.net环境，然后才安装 了IIS。