结合三维矩阵体的动态网络数据可视化

动态网络(Dynamic networks)数据与动态图(Dynamic Graph)数据一直以为都比较复杂,随着数据量的不断增大,为动态网络的分析与可视化带来了极大的挑战。另一方面,动态网络数据常常带有时间信息,而现有的时空高维数据可视化方法都有各种缺点,尤其是当图中节点密集时,现有的方法几乎都会遇到遮挡问题。

二维模型探索动态图数据已有很多种方法,如点边图 (Node-Link Diagram),邻接矩阵 (Adjacency Matrices) 等,这些方法可以很好地展现图中的节点自身的随时间变化的信息,但是节点以及节点之间关系的演化,在这些方法中比较难展现,尤其是节点个数多时,以及限制于一个视图中。用三维模型将时空高维数据可视化,增加一个维度可以展现更丰富的信息,但是也会带来更加严重的问题,例如相互遮挡,目标物体选择困难,交互不方便等问题。

本文[1]提出了一个新的交互探索模型,Matrix Cubes,该模型使用3D cube作为视图中枢协调者 (pivot visualization),管理多个不同角度的切片视图,这些切片视图全是从3D cube中导出的。系统还提供了一系列的交互,例如,刷选 (brushing),链接 (linking),和过滤 (filtering),为深入探索动态图数据提供了有效的方法。

具体而言,本文提出的3D cube是由二维的时序邻接矩阵从时间轴的角度串联起来形成的 (如图1b所示的matrix cube是由图1a中的邻接矩阵合并形成的),而每个邻接矩阵可以很好的展现每个时间步的点边图信息。得到3D cube之后,我们还可以沿着另外两个节点轴中任意一个轴对3D cube进行切割,得到一系列的节点切片 (vertex slices),如图1c所示。值得注意的是,本文主要针对的动态图都是无向图,因此,不管是沿着哪个节点轴进行切割,得到的结果都是一样的,因为邻接矩阵是对称的。从功能上来说,3D cube只是显示动态图的整体信息 (overview),而实际的探索与交互几乎都是在多个2D视图上进行的。在中间的3D cube上,用户可以刷选所有标签来过滤数据项或时间步,从而只显示用户感兴趣的信息。

图1. 3D cube与两个不同角度的切片序列

图2所示的是本系统的UI界面,左下角标识为a处有一个小cubelet,在这个cubelet上用户可以进行一些基本的交互。如果用户点击cubelet的右面 (红色线段围成的表面),3D cube将变成时间切片序列,时间切片序列对应于图1中的a图;如果用户点击cubelet的左侧,3D cube将变成节点切片序列,对应于图1中的c图。右边的面板为参数调节区域,用户可以选择不同的encoding方法,例如可以将基元元素的颜色 (cell color)表示权重信息,时间序列信息或其他信息,例如后面例子中的论文合作的频度信息。用户还可以选择将基元元素的大小 (cell size) 映射成权重或频度信息等。为了更好地发现节点之间的模式,用户可以使用不同的节点排序方法进行reranking。此外,还可以对数据进行过滤,例如,时间片上的过滤,权重上的过滤,以及可以允许用户调节视图切换时的过渡动画的速度。

图2. 系统的UI界面

为了减少用户的交互时间开销,该系统设计了四种预定制的视图,3D视图 (3D cube view),投影视图 (projection view),小卡片视图 (small multiples view)和切片旋转视图 (slice rotation view)。

首先在3D视图中,用户仅仅可以看到一些overview的信息,例如一些趋势或总体的分布等等。大部分的细节信息以及数据的模式都需要在后面三个2D视图中进行探索,在第二种视图,投影视图中,分为时间切片投影视图与节点切片视图。时间切片视图即切片排列成图1a中的形式,节点切片视图即图1b的形式。第三种视图即小卡片视图,所有的切片可以展开到一个2D平面上,方便用户进行对比并发现一些数据的规律。最后一个视图是切片旋转视图,用户可以选择3D cube中的任意一张切片,点击,旋转即可以看到切片的详细信息。总之,第一个3D视图与后面三个2D视图形成Overview和detail的关系,overview只能提供一些大致的context信息,而详细的信息还需要在后面三个2D视图进行探索。不管是3D视图还是2D视图,用户都可以将基元元素的颜色与大小映射成不同的信息。

图3. 四种预定制的视图

最后,本文还使用了两个具体的数据进行测试,第一个是称为ALMA的天线通信数据,该数据由一系列的观测太空的天线收集而成,每两个天线之间都会进行通信,因此这些通信就会有延迟信息,通信振幅信息,以及振幅均方值,和信息的信噪比,用本文的方法对这个AMLA数据进行测试,在小卡片视图中,发现很多异常的信息以及一些行为类似的信息。另一个数据是神经学研究中用到大脑刺激数据,神经学家对人体大脑的不同区域使用不同的刺激,收集这些不同的区域之间信号的传输情况。如图4所示,在这个数据中,用户通过小卡片视图与时间切片视图发现了有些区域明显比其他区域更活跃 (发送与接收信号都非常频繁),在时间切片视图中还发现了一些周期性的信息,最后,在节点切片视图中,用户可以很明显发现一些区域发送信号比接收信号明显更多 (红色表示发送信号的区域,蓝色表示接收信号的区域)。

本文作者:佚名

来源:51CTO

时间: 2024-11-18 22:21:13

结合三维矩阵体的动态网络数据可视化的相关文章

3d 三维模型-如何在Android系统利用三维矩阵数据生成三维面形

问题描述 如何在Android系统利用三维矩阵数据生成三维面形 即在android系统中实现类似于matlab中的mesh函数的功能 解决方案 你试试Unity-3d吧!

c++怎样从txt文档中读取数据写入到三维矩阵中

问题描述 c++怎样从txt文档中读取数据写入到三维矩阵中 用MATLAB获取了一幅彩色图像的像素值,得到一个400*300*3的三维矩阵,并保存到txt文档中,怎么写一个c++小程序,把txt中的数据写入到一个三维矩阵中? %读取第k个图像,所有像素 srcImg = imread(fullfile(SRC, srcName)); %保存像素值到txt文档,便于C++测试使用 fid = fopen('JPEG2TXT.txt', 'wt+'); if fid == -1, return, e

6年双11,DataV的数据可视化之道

文 | InfoQ 徐川 原文于2017年11月11日由 InfoQ-前端之巅发布,本文略有修改,已获得作者授权. 阅读原文 从 2012 年起,阿里每年的双 11 大促都会推出一个大屏,以多种生动的展示方式实时地显示交易情况.实时数据大屏,它的特点是各种大:屏幕大.数据量大.展示信息量大,可以说是数据可视化的圣杯. (图:2017 年双 11 的区域经济闪电图,将实时订单数据与物流干线结合展示) 阿里云DataV团队连续6年参与了双11媒体数字大屏搭建,今年的"中国区域经济闪电图"媒

MATLAB 数据分析方法(第2版)2.1 基本统计量与数据可视化

第2章 数据描述性分析   数据描述性分析是从样本数据出发,概括分析数据的集中位置.分散程度.相互关联关系以及数据分布的正态或偏态特征等.它是进行数据分析的基础,对不同类型量纲的数据有时还要进行变换,然后再作出合理分析.本章主要介绍样本数据的基本统计量.数据的可视化.数据分布检验及数据变换等内容.   2.1 基本统计量与数据可视化   2.1.1 一维样本数据的基本统计量   描述数据的基本特征主要为集中位置和分散程度.   设从所研究的对象(即总体)X中观测得到n个观测值 x1,x2,-,x

数据可视化:基本图表

"数据可视化"可以帮助用户理解数据,一直是热门方向. 图表是"数据可视化"的常用手段,其中又以基本图表----柱状图.折线图.饼图等等----最为常用. 用户非常熟悉这些图表,但如果被问道,它们的特点是什么,最适用怎样的场合(数据集)?恐怕答得上来的人就不多了. 本文是电子书<Data Visualization with JavaScript>第一章的笔记,总结了六种基本图表的特点和适用场合,非常好地回答了上面的问题. 零.序言 进入正题之前,先纠正一

Linux 数据可视化工具

Linux 上用来实现数据的图形可视化的应用程序有很多,从简单的 2-D 绘图到 3-D 制图,再到科学图形编程和图形模拟.幸运的是,这方面的工具有很多开放源码实现,包括 gnuplot.GNU Octave.Scilab.MayaVi.Maxima 等.每个工具都有自己的优缺点,并且都是针对不同的应用程序而设计的.对这些开放源码图形可视化工具进行一下探索,有助于我们更好地决定哪个工具最适合我们的应用程序. 内容 Gnuplot GNU Octave Scilab MayaVi Maxima 展

你会用吗?Linux五大数据可视化工具

可视化工具的简短列表 在本文中,将对很多流行的 Linux 数据可视化工具进行一下调查,并对其中一些工具进行更深入的探讨.例如,某个工具是否为进行数值计算而提供了一种语言?这个工具是交互式的还是提供了一种批处理模式来单独进行操作?可以使用这个工具进行图像或数字信号处理吗?这个工具是否提供了语言绑定来支持与用户应用程序的集成(例如 Python.Tcl.Java 编程语言等)?另外还将展示一些工具的图形化处理能力.最后,将分析每个工具的长处,从而帮助我们确定哪个工具最适合完成计算任务或数据可视化.

人人都会用到的数据可视化之常用图表类型

"数据可视化"可以帮助用户理解数据,一直是热门方向. 图表是"数据可视化"的常用手段,其中又以基本图表--柱状图.折线图.饼图等等最为常用. 用户非常熟悉这些图表,但如果被问到,它们的特点是什么,最适用怎样的场合(数据集)?恐怕答得上来的人就不多了. 本文是电子书<Data Visualization with JavaScript>第一章的笔记,总结了六种基本图表的特点和适用场合,非常好地回答了上面的问题. 序言 进入正题之前,先纠正一种误解. 有人觉

大数据可视化的最新动态

引言 数据可视化 是将数据以不同形式展现在不同系统中,其中包括属性和变量的单位信息.基于可视化发现数据的方法允许用户使用不同的数据源,来创建自定义分析.先进的分析集成了许多方法,为了支持交互式动画在台式电脑.笔记本电脑或平板电脑.智能手机等移动设备上创建图形桌面.根据调查,表1显示了数据可视化的好处. 对于可视化有以下几点建议 大数据 是大容量.高速度并且数据之间差异很大的数据集,因此需要新的处理方法来优化决策的流程.大数据的挑战在于数据采集.存储.分析.共享.搜索和可视化[5] 1."所有数据