环境：

centos 6.5  64

mysql 5.5.20 升级 5.6.25

mysql 5.5.20安装参考：

http://blog.csdn.net/u010098331/article/details/50730391

mysql 5.6.25安装参考：

     http://blog.csdn.net/u010098331/article/details/50886619

CentOS系统下将MySQL升级至5.6.25 （源码安装方式）

摘要：CentOS系统下将MySQL升级至5.6.25 （源码安装方式） ...

CentOS系统下将MySQL升级至5.6.10 （源码安装方式） 
进入MySQL mysql> show variables like '%datadir%'; 
原MySQL数据库目录/var/lib/mysql/   
#yum -y install cmake  #mysql5.5以后采用cmake方式，替换了原有的./configure 
#wget http://dev.mysql.com/get/Downloads/MySQL-5.6/ 
mysql-5.6.10.tar.gz/from/http://cdn.mysql.com 

#tar -zxvf mysql-5.6.10.tar.gz 
#cd mysql-5.6.10 
#cmake -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local/mysql #MySQL安装目录 
-DMYSQL_DATADIR=/usr/local/mysql/data #MySQL数据库目录 
-DDEFAULT_CHARSET=utf8  #默认字符集编码 
-DEXTRA_CHARSETS=all #扩展字符支持 
-DDEFAULT_COLLATION=utf8_general_ci #指定服务器默认的校对规则 
-DWITH_INNOBASE_STORAGE_ENGINE=1 #开启INNOBASE引擎 
-DWITH_ARCHIVE_STORAGE_ENGINE=1 #开启ARCHIVE引擎 
-DWITH_PERFSCHEMA_STORAGE_ENGINE=1  #开启PERFSCHEMA引擎 
-DWITH_PARTITION_STORAGE_ENGINE=1 #开启分区引擎 

#make && make install 
#service mysqld stop  #停掉原有MySQL服务 
#cp /usr/local/mysql/support-files/my-default.cnf \  
/etc/my.cnf  #覆盖原有的my.cnf 

# vi /etc/my.cnf   #加入并修改以下 
basedir = /usr/local/mysql #数据库安装目录 
datadir = /var/lib/mysql #原数据库数据目录 
skip-grant-tables #由于升级需要，跳过权限验证 
sql_mode=NO_ENGINE_SUBSTITUTION,STRICT_TRANS_TABLES 中 
#去掉STRICT_TRANS_TABLES，禁用数据严格模式 

#cp /usr/local/mysql/support-files/mysql.server \ 
/etc/init.d/mysqld #覆盖mysqld服务 

#service mysqld start #重启新版本MySQL 
#/usr/local/mysql/bin/mysql_upgrade
 -uroot -p原数据库密码 #执行表权限升级

报错请参考：

 http://blog.csdn.net/u010098331/article/details/50888362

#/usr/local/mysql/bin/mysqlcheck --all-databases -p密码 #检查所有数据库 
#vi /etc/my.cnf  #去掉skip-grant-tables  
#service mysqld restart #数据库升级成功 

以上步骤，本人已在生产环境中测试通过。。      
       
编译参数可参照MySQL官方文档： 
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/source-configuration-options.html#option_cmake_storage_engine_options
      

参考：

http://www.php1.cn/Content/CentOS_XiTongXiaJiang_MySQL_ShengJiZhi_5-6-10_YuanMaAnZhuangFangShi.html

http://xiedexu.cn/mysql-5-5-upgrade-to-mysql-5-6.htm

http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c197d4201017raf.html

http://www.eziep.net/details/1.html