9月20日，阿里巴巴集团宣布，云操作系统业务(云OS)将独立于阿里云事业群运行，接受集团直接管理，阿里巴巴集团首席数据官陆兆禧将兼任该业务总裁，阿里巴巴集团首席技术官王坚将兼任该业务董事长及CTO职务。阿里集团还将投资两亿美金给云OS业务，加强其在人才、技术和设施上的投入。
事实上，一周以来阿里云操作系统正处在被质疑的漩涡中——从未对采用安卓系统硬件厂商采取过任何过激行为的谷歌终于有了“第一次”：9月13日，在宏碁和阿里云上海手机发布会前一小时向宏碁施压，如果宏碁执意发布与阿里云合作手机，谷歌将取消对宏碁Android授权。发布会流产。
宏碁第二日则表示，会在与谷歌沟通后继续与阿里云保持合作。
9月15日谷歌发表声明，认为“阿里云系统是‘山寨版’Android，但该系统又不兼容Android，这将弱化生态系统”。
一篇报道引发的战争
一切矛盾爆发的导火索是一篇华尔街的报道。
一位接近谷歌的人士透露，宏碁一事爆发后他曾经问过谷歌安卓的人，谷歌的人告诉他，起初谷歌并没有注意到阿里云操作系统，是看到了华尔街日报上的一篇报道《Alibaba‘s Aliyun Operating System Taking on Android in China》(记者注译：《阿里云操作系统在中国挑战安卓》)后，就分析了一下阿里云操作系统，结果发现除了JAVA虚拟机外，就是安卓，但阿里却不承认。谷歌的说法是，可以看出阿里云曾经试图努力想兼容安卓应用，但是做得不好，结果有部分安卓开发者的应用不能被很好地兼容，有些特定的东西无法支持。
对这次事件，五季咨询分析师洪波称，这实际上相当于用安卓来挑战安卓。
华尔街的报道写道：“中国已经有了本土研发的、试图在中国迅速增长的智能手机市场上与安卓叫板的软件。”
阿里巴巴集团(Alibaba Group)总参谋长曾鸣在接受《华尔街日报》采访时表示，移动设备生产商对去年推出的“阿里云”移动操作系统的需求增强。他还透露，今年年底前搭载基于Linux的阿里云的智能手机厂商数将从目前的天语和海尔增至5家。
曾鸣还在采访中称，安卓在中国面临挑战，因为谷歌搜索、谷歌地图和Gmail功能在中国不是无法使用就是受到限制。他认为安卓在中国无法提供的服务和良好体验，阿里云却可以。
据悉，苹果的iOS和谷歌的安卓操作系统中，应用程序是安装在手机上的。与此不同的是，阿里云运行的是存储在远程服务器上的基于网络的应用程序。此外，阿里云还有自己的地图和电子邮件应用。
阿里国际公关部副总裁John Spelich对此事的回应是，阿里云是一个以开源代码为基础的OS，是一个开放的生态系统，允许其他人在其云端运行他们的移动互联网服务。阿里云是一个包容其他互联网公司的生态系统，而安卓不是这样的，因为他们的应用是需要下载使用。
John Spelich认为，这是整个阿里云与谷歌的应用市场的矛盾症结所在。云是开放的，而应用系统是封闭的，因为这是由应用市场的运营者控制的。这是两个竞争的生态系统，一个是通过云开放的，而另外一个是封闭的，并且只允许他们想给用户看到的应用。
谷歌的目的
洪波称，在谷歌人士看来，阿里云就是基于安卓做的深度开发，尽管他们也极力在试图兼容安卓，但事实上就是不能兼容。而宏碁是安卓联盟OHA成员单位之一，有协议要维护安卓的兼容性，抵制不兼容的做法。
于是，谷歌愤怒了，给宏碁施压。
在洪波看来，谷歌愤怒的原因有两点，其一，阿里对安卓进行了改动，且不承认是安卓;其二，对安卓应用不能完全很好地兼容，将可能导致安卓阵营分裂。事实上，还有第三点，就是在阿里云的应用商店中有很多是盗版应用，不是开发者上传的应用，且很多应用的开发者根本就不是原作者。
洪波指出，根据第三版GPL(GPL为GNU通用公共许可证的简称)许可协议，而且是传染性许可证——只要软件中使用了GPL的代码，那么就必须以GPL开放源代码，并且项目中也不能有任何和GPL不兼容的库。这意味着，如果阿里云是基于Linux的，那么他们必须遵守GPL，必须开源。
当然，看起来Linux的开源规定并没有什么效力，GPL 第三版本身也正存在争议，甚至顶级Linux开发者称“GPLv3将害死开源事业”，Linux之父对新GPL许可协议也表达了强烈不满。中兴的一位技术高层也指出，黑莓等其实也是基于Linux的，但是也没有公开源代码。
现在，阿里云既不承认自己是安卓，也不公布源代码，一切看似都在迷雾中。
但易观分析师刘鹏认为，谷歌抵制阿里云是因为阿里云操作系统不兼容安卓，肯定不是最主要也不是唯一的原因。谷歌希望通过抵制阿里云操作系统，从而达到打压和微软关系密切的宏碁的目的，以诺基亚为首的WP8手机的出炉，还有安卓阵营的三星、HTC、联想、索尼等纷纷要推出WP8手机，这或许才是谷歌更为忌惮的。
阿里云公关总监杨磊称，时至今日，谷歌方面并没有正面接触阿里云。宏碁是应该有权利自己选择使用什么操作系统的，正如HTC可以选择多个操作系统一样。
易观国际分析师刘鹏认为，目前阿里云操作系统在市场上无论是份额还是品牌影响力，都不足以对谷歌造成任何威胁，但是从长远看，它已经被谷歌认为是Android未来强有力的竞争对手。
Android操作系统是一种开放性的操作系统，谷歌此番言论似乎和其一直以来秉承的开放态度自相矛盾，因此谷歌试图统一Android操作系统的目的也直接揭开。
刘鹏表示，阿里云不兼容An-droid就意味着阿里云操作系统和谷歌没有任何关系，无论是在相关产品和专利的授权上，还是在对整个Android生态系统的控制上，谷歌都不能从阿里云身上占到任何便宜，反而白白增加了一个竞争对手。面对火狐OS，阿里云OS等新势力的出现，谷歌或许真的感到了恐慌，以阿里云开刀，试图达到杀一儆百的目的是存在的。
但洪波并不同意这样的说法，他表示，只要是依托Android做深度开发，都有可能排除谷歌的应用，比如亚马逊的Kindle Fire，以及国内的小米MIUI，都部分或全部剔除了谷歌的应用，谷歌并未有任何表示。
看起来，宏碁也是此次事件的最大受害者。
目前，宏碁在PC市场表现疲软，进军移动终端市场是其不二选择，但无论是从渠道、品牌还是与其他厂商合作方面，宏碁在手机市场没有任何积累，更谈不上优势。在目前的国内手机市场，竞争激烈，既有苹果、三星等海外厂商，也有中兴、华为等国内巨头，还有小米等互联网厂商，对于宏碁来说，切入手机市场本就困难重重，此次寻求和阿里云合作又遭到谷歌抵制，苦不堪言。
阿里云公关总监杨磊表示，在9月20日的阿里云公司成立三周年年会上，前来祝贺的宏碁高层表示，将会继续和阿里合作，推出更多的搭载云OS系统的智能手机。
阿里的“苦衷”
阿里云既不承认自己是安卓进行的二次开发，又不公开源代码以证明自己是Linux技术，原因究竟为何?
事实上，阿里巴巴如果不是安卓或不能很好地兼容安卓应用对其都是不利的。
周鸿祎曾对本报表示，其实研发出一个手机操作系统并不难，难的是这个操作系统是一个生态链，必须得到上游厂商和下游开发者的支持。
是的，阿里巴巴不能完全采用安卓系统，必须改动，则将面临另外一个问题——能否有实力重新建立起一个新的生态系统?
一种可能的猜测是，阿里正在积极争取中国的核高基项目。
在洪波看来，阿里云操作系统不承认自己是安卓，原因之一是该公司正在参与国家的核高基项目。要想成为核高基重大专项的项目，就必须是自有知识产权的，如果承认了是安卓，就无法得到相应的核高基重大专项资格。
据悉，今年8月10日，阿里云计算参加了首届中国(青岛)国际软件融合创新博览会。而阿里巴巴正是作为国内领先的云计算企业出席，并且出现在“核高基”成果展区参展，而这一部分正是此次参会重点。该展区集中展示了近年来“核高基”专项成果，参展企业均为承担国家重大专项的50家国内重点软件企业。阿里巴巴在这次展会上主要展示的正是云OS系统及搭载阿里云OS的多样化终端。此外，阿里巴巴还展出了云计算服务及典型客户案例。
而获得核高基项目的企业将可以获得政府相应的补贴。
当然，对于动辄研发投入就是以亿为单位计算的阿里巴巴来讲，核高基的补贴可能并不是其最关心的，而获得了核高基项目的企业还有一个可能的好处是：政府将帮助其推广产品，向国内的厂家推荐使用。
如果这个猜测有一定道理，那么也许这才是谷歌所说的——“可以看出阿里云操作系统曾经试图努力想兼容安卓应用”的原因。