2.2 数据清洗
在本节中,我们将回顾一些Spark平台上的数据清洗方法,重点关注数据不完备性。然后,我们将讨论一些Spark数据清洗方面的特殊特征,以及一些基于Spark平台更加容易的数据清洗解决方案。
学习完本节,我们将能够完成数据清洗,并为机器学习准备好数据集。
2.2.1 处理数据不完备性
对于机器学习,数据越多越好。然而,通常数据越多,“脏数据”也会越多——这意味着会有更多的数据清洗工作。
数据质量控制可能会有许多问题需要处理,有些问题可能很简单,如数据输入错误或者数据复制。原则上,解决他们的方法是类似的——例如,利用数据逻辑来实现探索和获取项目的本质知识,利用分析逻辑来纠正他们。为此,在本节中,我们将重点关注缺失值处理,以便说明在这个主题上Spark的使用方法。数据清洗涵盖了数据的准确性、完整性、独特性、时效性和一致性。
虽然听起来可能很简单,但是处理缺失值和不完备性并不是一件容易的事情。它涉及许多问题,往往需要以下步骤:
1.计算数据缺失百分比。
这取决于研究项目,有些项目中的比例如果低于5%或10%,我们可能不需要在数据缺失问题上花费时间。
2.学习数据缺失的模式。
数据缺失有两种模式:完全随机或不随机。如果数据缺失是完全随机的,我们可以忽略这个问题。
3.确定解决数据缺失模式的方法。
处理数据缺失有几种常用的方法。均值填充,缺失数据删除,数据替换是最为主要的方法。
4.为数据缺失模式执行数据填补。
为了处理数据缺失和不完整性,数据科学家和机器学习从业者通常会利用他们熟悉的SQL工具或R语言编程。幸运的是,在Spark环境中,有Spark SQL和R notebook可以让用户继续使用他们熟悉的方法,为此,我们将在下面两节中进行详细阐述。
数据清洗也包含其他的问题,诸如处理数据输入错误和异常值。
2.2.2 在Spark中进行数据清洗
在上一节中,我们讨论了处理数据不完备性。
安装Spark后,我们可以很容易地在DataBricks Workspace中使用Spark SQL和R notebook处理上一节中所描述的数据清洗工作。
特别需要指出的是,sqlContext中的sql函数使得应用程序能够完成SQL查询编程,并返回一个DataFrame类型的结果。
例如,借助R notebook,我们可以用下面的语句来执行SQL命令,并把结果放到一个data.frame:
数据清洗是一个非常繁琐和耗时的工作,在本节,我们想请你关注SampleClean,对于机器学习从业者,它可以使数据清洗更为简单,特别是分布式数据清洗。
SampleClean是建立在AMPLab伯克利数据分析栈(BDAS)上的一个可扩展的数据清洗库。该库使用Apache Spark SQL 1.2.0及以上版本和Apache Hive来支持分布式数据清洗操作和相关的脏数据查询处理。 SampleClean可以执行一组可互换和可组合的、物理和逻辑的数据清洗操作,这使得我们可以快速地构建和调整数据清洗pipelines。
我们先在Spark和SampleClean中输入以下命令开启工作:
使用SampleClean,我们需要创建一个名为SampleCleanContext的对象,然后使用该上下文来管理工作会话中所有的信息,并提供API基元与数据进行交互。 SampleCleanContext由SparkContext对象构造而成,具体如下:
2.2.3 更简便的数据清洗
使用SampleClean和Spark,我们可以把数据清洗工作变得容易,可以编写更少的代码,并利用更少的数据。
总体而言,SampleClean采用了一个很好的策略。它采用异步方式以规避延迟,并使用采样来规避数据体量巨大的问题。此外,SampleClean在一个系统中结合了所有三个方面因素(算法、机器和人),因此变得更加高效。
更多使用SampleClean的信息,请访问:http://sampleclean.org/guide/ 和http://sampleclean.org/release.html。
为了更好地说明,让我们假设一个有四个数据表的机器学习项目:
要清洗这个数据集,我们需要:
无论是使用SQL还是R语言命令,都要计算每个变量有多少个缺失值。
如果我们选择的策略是均值填充,那么用平均值填补缺失值。
尽管上述工作很容易实现,但是在数据体量巨大的情况下,这样做有可能非常耗时。因此,为了提高效率,我们可能需要将数据分割成许多子集,同时并行完成前面的步骤,Spark是完成此项工作的最佳计算平台。
在Databricks R notebook环境中,我们可以先用R语言命令sum(is.na(x))创建notebook来计算数据缺失的情况。
为了用平均值替代缺失值,我们可以使用下面的代码:
在Spark中,我们可以轻松地对所有的数据集群使用R notebook。