R语言 典型相关分析

1 关键点:#典型相关分析#
#典型相关分析是用于分析两组随机变量之间的相关程度的一种统计方法,它能够有效地揭示两组随机变量之间的相互(线性依赖)关系
#例如 研究生入学考试成绩与本科阶段一些主要课程成绩的相关性
#将研究两组变量的相关性问题转化为研究两个变量的相关性问题 此类相关为典型相关#

2 分类:#总体典型相关#样本典型相关

3 R语言提供的计算函数:

#典型相关计算 cancor(x,y,xcenter=TRUE,ycenter=TRUE)
#x,y是相应的数据矩阵 xcenter,ycenter是逻辑变量 TRUE是将数据中心化 FALSE是不中心化

4 分析结果含义

#cor是典型相关系数

#xcoef是对应于数据x的系数 又称关于数据x的典型载荷即样本典型变量U系数矩阵A的转置
#xcenter是数据X的中心 即数据X的样本均值

#y是对应于数据x的系数 又称关于数据y的典型载荷即样本典型变量V系数矩阵B的转置
#ycenter是数据Y的中心 即数据Y的样本均值

4 分析步骤

#1.载入原始数据 data.frame
#2.原始数据标准化 scale
#3.典型相关分析 cancor

#4.相关系数显著性检验 corcoef.test.R

5 案例

#现对20名中年人测得三个生理指标:体重(X1) 腰围(X2) 脉搏(X3)
#三个训练指标:引体向上(Y1) 起座次数(Y2) 跳跃次数(Y3) 试分析这组数据的相关性

#用数据框的形式输入数据
test<-data.frame(
X1=c(191, 193, 189, 211, 176, 169, 154, 193, 176, 156,
189, 162, 182, 167, 154, 166, 247, 202, 157, 138),
X2=c(36, 38, 35, 38, 31, 34, 34, 36, 37, 33,
37, 35, 36, 34, 33, 33, 46, 37, 32, 33),
X3=c(50, 58, 46, 56, 74, 50, 64, 46, 54, 54,
52, 62, 56, 60, 56, 52, 50, 62, 52, 68),
Y1=c( 5, 12, 13, 8, 15, 17, 14, 6, 4, 15,
2, 12, 4, 6, 17, 13, 1, 12, 11, 2),
Y2=c(162, 101, 155, 101, 200, 120, 215, 70, 60, 225,
110, 105, 101, 125, 251, 210, 50, 210, 230, 110),
Y3=c(60, 101, 58, 38, 40, 38, 105, 31, 25, 73,
60, 37, 42, 40, 250, 115, 50, 120, 80, 43)
)

#为了消除数量级的影响 将数据标准化处理 调用scale函数
test<-scale(test)
#对标准化的数据做典型相关分析
ca<-cancor(test[,1:3],test[,4:6])
#查看分析结果
ca

#计算数据在典型变量下的得分 U=AX V=BY
U<-as.matrix(test[, 1:3])%*% ca$xcoef
V<-as.matrix(test[, 4:6])%*% ca$ycoef
#画出U1、V1和U3、V3为组表的数据散点图
plot(U[,1], V[,1], xlab=”U1″, ylab=”V1″)
plot(U[,3], V[,3], xlab=”U3″, ylab=”V3″)

由散点图可知 第一典型相关变量分布在一条直线附近 ;第三典型相关变量数据很分散。
#典型相关系数的显著性检验
#作为相关分析的目的 就是选择多少对典型变量?因此需要做典型相关系数的显著性检验
#若认为相关系数k为0 就没有必要考虑第k对典型变量了

#相关系数检验R程序
source(“E:/R/corcoef.test.R”)
corcoef.test(r=ca$cor,n=20,p=3,q=3)

最终程序运行结果显示选择第一对典型相关变量。

典型相关系数检验 R语言程序 corcoef.test.R 将其保存在计算机的E盘的R文件夹下

corcoef.test<-function(r, n, p, q, alpha=0.1){
#r为相关系数 n为样本个数 且n>p+q
m<-length(r); Q<-rep(0, m); lambda <- 1
for (k in m:1){
lambda<-lambda*(1-r[k]^2); #检验统计量
Q[k]<- -log(lambda) #检验统计量取对数
}
s<-0; i<-m
for (k in 1:m){
Q[k]<- (n-k+1-1/2*(p+q+3)+s)*Q[k] #统计量
chi<-1-pchisq(Q[k], (p-k+1)*(q-k+1))
if (chi>alpha){
i<-k-1; break
}
s<-s+1/r[k]^2
}
i #显示输出结果 选用第几对典型变量
}

时间: 2024-09-18 02:27:18

R语言 典型相关分析的相关文章

R语言数据挖掘

数据分析与决策技术丛书 R语言数据挖掘 Learning Data Mining with R [哈萨克斯坦]贝特·麦克哈贝尔(Bater Makhabel) 著 李洪成 许金炜 段力辉 译 图书在版编目(CIP)数据 R语言数据挖掘 / (哈)贝特·麦克哈贝尔(Bater Makhabel)著:李洪成,许金炜,段力辉译. -北京:机械工业出版社,2016.9 (数据分析与决策技术丛书) 书名原文:Learning Data Mining with R ISBN 978-7-111-54769-

《R的极客理想——高级开发篇 A》一一2.4 R语言中的遗传算法

2.4 R语言中的遗传算法 问题 如何用R语言进行遗传算法的计算? 引言 人类总是在生活中摸索规律,把规律总结为经验,再把经验传给后人,让后人发现更多的规律,每一次知识的传递都是一次进化的过程,最终形成了人类的智慧.自然界的规律,让人类适者生存地活了下来,聪明的科学家又把生物进化的规律,总结成遗传算法,扩展到了更广的领域中.本节将带你走进遗传算法的世界.2.4.1 遗传算法介绍 遗传算法是一种解决最优化的搜索算法,是进化算法的一种.进化算法最初借鉴了达尔文的进化论和孟德尔的遗传学说,从生物进化的

《R语言数据分析》——1.4 从数据库中导入数据

1.4 从数据库中导入数据 使用一个专用的数据库测试平台比根据需要从磁盘中导入文件效率要高很多,这是由数据库本身特性决定的: 对大数据表的访问速度更快 在数据导入R前,提供了更快更有效的数据聚集和筛选方法 相比电子表格以及R对象实现的传统矩阵模型,能够提供更加结构化的关系 数据模型来存储数据 提供对数据的连接及合并操作 在同一时间支持对多个客户端的并发远程访问 提供了安全和有限的访问 提供可扩展及可配置的数据存储后台 DBI包提供了数据库操作的接口,可以作为R和不同关系数据管理系统(Relati

《R语言数据挖掘》----导读

Preface 前 言 世界各地的统计学家和分析师正面临着处理许多复杂统计分析项目的迫切问题.由于人们对数据分析领域的兴趣日益增加,所以R语言提供了一个免费且开源的环境,非常适合学习和有效地利用现实世界中的预测建模方案.随着R语言社区的不断发展及其大量程序包的不断增加,它具备了解决众多实际问题的强大功能. R编程语言诞生已经有数十年了,它已经变得非常知名,不但被社区的科学家而且被更广泛的开发者社区所熟知.它已经成长为一个强大的工具,可以帮助开发者在执行数据相关任务时生成有效且一致的源代码.由于R

《R语言编程艺术》——1.4 R语言中一些重要的数据结构

1.4 R语言中一些重要的数据结构 R有多种数据结构.本节将简单介绍几种常用的数据结构,使读者在深入细节之前先对R语言有个大概的认识.这样,读者至少可以开始尝试一些很有意义的例子,即使这些例子背后更多的细节还需要过一段时间才能揭晓.1.4.1 向量,R语言中的战斗机 向量类型是R语言的核心.很难想象R语言代码或者R交互式会话可以一点都不涉及向量. 向量的元素必须属于某种"模式"(mode),或者说是数据类型.一个向量可以由三个字符串组成(字符模式),或者由三个整数元素组成(整数模式),

《机器学习与R语言(原书第2版)》一2.3 探索和理解数据

本节书摘来自华章出版社<机器学习与R语言(原书第2版)>一书中的第2章,第2.3节,美] 布雷特·兰茨(Brett Lantz) 著,李洪成 许金炜 李舰 译更多章节内容可以访问"华章计算机"公众号查看. 2.3 探索和理解数据 在收集数据并把它们载入R数据结构以后,机器学习的下一个步骤是仔细检查数据.在这个步骤中,你将开始探索数据的特征和案例,并且找到数据的独特之处.你对数据的理解越深刻,你将会更好地让机器学习模型匹配你的学习问题. 理解数据探索的最好方法就是通过例子.在

跟我一起数据挖掘(9)——R语言

R是用于统计分析.绘图的语言和操作环境.R是属于GNU系统的一个自由.免费.源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具. 一.基本介绍: 1. 警告:在输入命令前请切换到英文模式.否则你的一大段代码可能因为一个中文状态的括号而报错,R语言的报错并不智能无法指出错误的具体位置.最可怕的是不报错但就是无法输出正确结果. 2. 警告:R语言区别大小写,所以对象A与对象a并不一样,在调用函数.R包时也要注意大小写. 3. R软件由R包组成,每个包里有各种函数.命令"library()&q

《R语言编程艺术》——导读

前言 R是一种用于数据处理和统计分析的脚本语言,它受到由AT&T实验室开发的统计语言S的启发,且基本上兼容于S语言.S语言的名称代表统计学(statistics),用来纪念AT&T开发的另一门以一个字母命名的编程语言,这就是著名的C语言.后来一家小公司买下了S,给它添加了图形用户界面并命名为S-Plus. 由于R是免费的,而且有更多的人贡献自己的代码,R语言变得比S和S-Plus更受欢迎.R有时亦称为GNU S,以反映它的开源属性.(GNU项目是开源软件的一个重要集合.) 为什么在统计工作

R语言学习路线和常用数据挖掘包

对于初学R语言的人,最常见的方式是:遇到不会的地方,就跑到论坛上吼一嗓子,然后欣然or悲伤的离去,一直到遇到下一个问题再回来.当然,这不是最好的学习方式,最好的方式是--看书.目前,市面上介绍R语言的书籍很多,中文英文都有.那么,众多书籍中,一个生手应该从哪一本着手呢?入门之后如何才能把自己练就成某个方面的高手呢?相信这是很多人心中的疑问.有这种疑问的人有福了,因为笔者将根据自己的经历总结一下R语言书籍的学习路线图以使Ruser少走些弯路. 本文分为6个部分,分别介绍初级入门,高级入门,绘图与可