优化网站结构有两方面的意思，一是物理结构，二是逻辑结构。网站物理结构指的是网站真实的目录及文件所存储的位置所决定的结构。
一般来说不较好的物理结构可以有两种：一种是扁平式结构，另一种是树形的结构，扁平的结构适合更适合小型网站，二树形结构更适合大型网站
扁平式的网站结构，也就是说所有的网站都存在根目录下面，比如：
http://www.xxxx.cn/index.html
http://www.xxxx.cn/Web-Case.html
所有这些页都是在根目录这一级别，形成一个扁平的物理结构。这比较适合于小型的网站，因为如果太多文件都放在根目录下的话，制作和维护起来都比较麻烦，容易搞乱。
第二种就是树型结构，也就是根目录下分成多个频道，或者叫类别，目录等，别管名称是什么，都是一个意思，然后在每一个频道下面再放上属于这个频道的网页。比如频道分为:
http://www.xxxx.cn/wangzhanjianshe/
在频道下再放入具体的内容网页:
http://www.xxxx.cn/wangzhanjianshe/wangzhanjianshe-mb.html
网站结构的第二个意义指的是逻辑结构或链接结构，也就是由网页内部链接所形成的逻辑的或链接的网络图。
比较好的情况是逻辑结构与前面的树型物理结构相吻合，也就是说:
主页链接向所有的频道主页。
主页一般不直接链接向内容页，除非是你非常想推的几个特殊的页。
所有频道主页都连向其他频道主页。
频道主页都连回网站主页。
频道主页也连向属于自己本身频道的内容页。
频道主页一般不连向属于其他频道的内容页。
所有内容页都连向网站主页。
所有内容页都连向自己的上一级频道主页。
内容页可以连向同一个频道的其他内容页。
内容页一般不连向其他频道的内容页。
内容页在某些情况下，可以用适当的关键词连向其他频道的内容页。
频道形成分主题。
仔细读前面这几句话，你可以清楚的看到这些链接会很自然的形成一个树型的网络图，而这种逻辑的或链接的网络可以与物理结构重合，也可以不一样。比如扁平式的物理结构网站也完全可以通过链接形成逻辑上的树型结构。现在可能有人会说搜索引擎不是不喜欢那么深的结构吗?当然在结构上也要控制一下，什么事情都不能过分吗?还有人可能还会说那么深会抓取到吗?我认为其实是可以的，就看你怎么做了，如果你直接在首页做个最底层页的链接，那么一定能抓取到。
上面说了半天只说明了下网站大体的结构，其实在日常的制作时，这些结构我们也可以灵活运用，并不矛盾，也不冲突，结构只要清晰合理就行。下面是我的经验和我总结的一些细节问题，希望对大家有所帮助：
其实对于seo来说网站页面的灵活性也很重要，首页最好天天都有新东西，怎么说首页也是整个网站权重最高的，也是蜘蛛经常来的，最好在首页做个随机的页面或者做个最新发表的文章，z-blog博客程序为什么受到广大博主的喜欢，就是在结构上优化的很好。
第二：导航，最好在网站底部出现一次，那样既能解决flas导航的不足，还能弥补上下呼应的问题。
第三：最重要的东西一定要放到网站的上面偏左的部分，因为蜘蛛是从左上到右下抓取的。
第四：每个页面都要有个指向首页的链接，每个页面都要链接网站重要的页面。
第五：在网站底部要做个链接网站的链接，栏目一定不要太多，能在一页显示的就放在一页，大多数人不愿意翻页。
第六：关键的网页一定要在首页有个指向的链接，这样可以提升内容页的权重，也容易抓取到。
第七：大的网站一定要有站内搜索，现在时间就是金钱，没有人会挨个找的。
第八：网站一定要有互动性，要有留言和评论什么的，要是文章型的，一定要可以发表文章，那样才能粘住浏览者。