通常的连接方式中，通信是以非加密的形式在网络上传播的，这就有可能被非法窃听到，尤其是用于认证的口令信息。为了避免这个安全漏洞，就必须对传输过程进行加密。对HTTP传输进行加密的协议为HTTPS，它是通过SSL（安全Socket层）进行HTTP传输的协议，不但通过公用密钥的算法进行加密保证传输的安全性，而且还可以通过获得认证证书CA，保证客户连接的服务器没有被假冒。
使用公用密钥的方式可以保证数据传输没有问题，但如果浏览器客户访问的站点被假冒，这也是一个严重的安全问题。这个问题不属于加密本身，而是要保证密钥本身的正确性问题。要保证所获得的其他站点公用密钥为其正确的密钥，而非假冒站点的密钥，就必须通过一个认证机制，能对站点的密钥进行认证。当然即使没有经过认证，仍然可以保证信息传输安全，只是客户不能确信访问的服务器没有被假冒。如果不是为了提供电子商务等方面对安全性要求很高的服务，一般不需要如此严格的考虑。
虽然Apache服务器不支持SSL，但Apache服务器有两个可以自由使用的支持SSL的相关计划，一个为Apache-SSL，它集成了Apache服务器和SSL，另一个为Apache+mod_ssl，它是通过可动态加载的模块mod_ssl来支持SSL，其中后一个是由前一个分化出的，并由于使用模块，易用性很好，因此使用范围更为广泛。还有一些基于Apache并集成了SSL能力的商业Web服务器，然而使用这些商业Web服务器主要是北美，这是因为在那里SSL使用的公开密钥的算法具备专利权，不能用于商业目的，其他的国家不必考虑这个专利问题，而可以自由使用SSL。
虽然通常mod_ssl以及其他复杂的Apache模块都提供了详细的编译安装说明，并提供了非常有用的脚本程序和Makefile来帮助使用者进行安装。然而为Web服务器增加一个模块并不是一个简单而易于描述的任务，幸运的是，FreeBSD提供了Ports Collection，让使用者不必关系每一步安装细节就能安装好这个模块。
如果不打算使用Ports Collection来安装mod_ssl，那么事情就略微麻烦一些，必须自己手工下载Apache的源代码，以及mod_ssl的代码，按照说明一步步的编译安装。
Apache+mod_ssl依赖于另外一个软件：openssl，它是一个可以自由使用的SSL实现，首先需要安装这个Port（由于专利的影响，这些软件无法制作为可以直接安装的二进制软件包，必须使用Ports Collection 安装）。openssl位于/usr/ports下面的security子目录下，当下载其源程序之前，需要设置环境变量USA_RESIDENT为NO，以避开专利纷争。