“云计算可以极大地节约成本”，云服务提供商如是说。的确，大多数企业选择云计算这个平台，成本控制是主要考虑因素。但是，随着采用云服务的时间越来越长，不少企业发现其使用成本在不断增加。
云计算在使用过程中，有几大隐性成本不被注意，但其真实存在。
一是对SSL证书的管理问题。企业存在云端的数据、信息，不是固定不动的，根据实时需 求，需要彼此进行传输，或者在本地与云端之间进行流动，为了保证这种流动的安全性，SSL证书是必不可少的。SSL加密是云计算的基础，一旦选择了云计 算，企业就必须掌握有效管理SSL证书的方法。而很多私有云的使用者都表示，管理SSL证书是一项十分复杂的工作；公有云用户的情况也不乐观，他们并不能 确定自己服务商的SSL证书管理是否达到了要求。
二是云中数据管理效率低，浪费存储空间。云存储的原则是使用多少空间则支付多少费用，理论上来说，降低成本的途径是高效管理数据，保证云中数据的价值性。实际情况是，云存储的数据使用率很低，平均还不到20%，云中数据的重复率也很高，占用了不必要的空间。
三是云端数据的备份和事故后的恢复问题。数据进入云存储器，并非进入了无坚不摧的保险箱，事实上保险箱都有被攻破的可能。但是很多企业在进行云迁移时，并没有认真考虑过数据备份，超过50%的企业都有数据丢失情况，而这些丢失的数据，大部分都恢复失败，造成很大的损失。
一般而言，企业将业务迁移到大的云服务商平台，技术上是绝对有保证的，但不能排除突发性自然灾害造成的基础设施损害，而这种物理性丢失造成的影响往往很恶劣，即使亚马逊这样的大牌服务商，也不能幸免。
对于一个初涉云计算，想构建私有云的企业，IT从业人员缺少经验，操作失误，也易导致成 本增加。常规虚拟化技术和云计算相关，但由不同的技术架构、成本结构以及操作模式组成，这点往往成为企业高层的管理盲区，致使人员的培训不足。在后期转化 服务器虚拟化时，这个弊端就会显现出来。
从构成来看，以上隐性成本都可以通过企业加强技术训练或者优化管理来规避，关键在于管理者的重视度不够，所以不得已为之付出昂贵代价。