2006年春看了一篇叫《">生物医学知识整合论》的论文，可以抽象成对信息与知识、认识论、世界观的解释，简直是哲学……翻出来看看还挺有意思，贴一下吧。最近工作又处于超忙状态，已经连续很多天，团队每天都到11点以后下班了，为了文章最后说的那个活动。淘宝绝对还是一个运营驱动的公司，回来，看看这份有趣的读书笔记吧。
l 是我们人类的科学活动而不是机体本身把机体分解为量子生物学、分子生物学、生物物理学、生物化学、细胞学、组织学、解剖学、生理学、免疫学、遗传学？？各层次。相反，大自然把万千机制都有条不紊地融为一体，把无数元素、无数机制融合和联合成一个完美的动态网络。因此，笔者认为把所有的生物医学知识重新连接或整合起来的努力顺应了大自然的意志。
l 局整问题称得上是一个基本宇宙矛盾。它与另一个基本原理即所谓经济原理（或称最低能量通道原理）有内在的联系。个体的本能行为总是“急功近利”的，但群体的前途（实际上最终也是个体的前途）却并非完全决定于个体的“急功近利”行为，很多情况下往往适得其反，群体的前途决定于个体行为的“总和”或整合。再往深处探究也许要追溯到更基本的原理即场或势的空间不均匀原理（场或势的空间距离原则），即任何事物在广义和狭义空间中都有近强远弱的规律。从主体自身看出去肯定是这样的，所以我们要扩大视野。例如物种的数目极度增加。
l 人类在科学研究上也有明显的急功近利倾向。科学探索行为一般都是先从获得简单的、直接的知识着手，……这样研究出来的是一种低端近似，不是本质。
l 长期以来，知识整合就是很多科学家特别是系统学家的追求和理想，但往往被放在哲学或数学等理论象牙塔中进行讨论，或把它当成一种智慧追求或思维享受，并不实际地论及具体的知识整合问题。作者认为“一旦开始……就可能立刻掉入万劫不复的云天雾海中，难有出头之日……但不能放弃”。
l 自然和生物系统对人类认识来讲是无穷的，人类对它们的认识具有相对性，人类对生命的知识和理解总是取决于当代的科学手段和认知水平。对于人类的认识能力来讲，它们永远是可望而不可及的迷，人类对它们的理解永远只能是一种模拟和近似。所以知识整合的任务是不断地、逐步地逼近对人体系统的整体理解，不断地、逐步地逼近对疾病及其控制过程的整体理解。形象思维是人类本能，“逻辑思维一般是经过逐步训练的抽象和分析思维能力”，而我经历的现有教育缺乏这方面训练。知识：显性和隐性（“存储媒体形式为神经系统，其本质和特点我们至今了解甚少”）。
l 我们不可能离开人类当时的认知水平、认知方法手段或认知语境（context）来谈论世界是什么样的。……但基于经济原则，人类在自然语言或其他信息交流中对双方不言自明的部分常常予以省略……
l 人类的科学研究活动把世界分析得越来越细，从中我们获得了大量分析意义下的知识和细节，整合的任务是根据这些分析性知识和细节重新组装成一个模拟世界或世界模型。这是任务，了解而已，而更有意义的是目的，预测、指导行动。
l 从哲学角度看，思维科学的探索是“用智慧研究智慧”，似有“狗逐自家尾巴”悖论之虑，这也提示了这一探索道路之艰难坎坷。
l 知识可看作是客观物理世界的在我们意识世界中的模型。反之，客观物理世界是知识和意识世界的原型或母型。……而作为“第三者”，数据——信息——知识系统是物理世界与意识世界二者模型的混合，既有物理性的一面，又有意识性的一面。