安装MySQL5.1过程中，我把以前MySQL5.0的GUI工具和服务器全部删掉，安装目录全部删掉，数据文件目录名字改掉，注册表用完美卸载清理了。
然后重启安装MySQL5.1（我以前遇到过服务启动不了的情况，这样做就搞定了），可配置到最后一步时出现Cannot create windows service for MySQL.error:0错误，把配置工具关掉重试几次都不行，后来百度了下，听说要在系统管理员用户下执行sc delete mysql删除MySQL服务后再启动配置工具配置，实在不行重启后再试。
我删掉服务再配置还是同样错误，再删掉服务，重启后配置还是不行。
又在网上参考了好些文章，最后解决办法如下：
1.出现错误后关掉配置工具，在系统管理员帐户下执行命令：sc delete mysql（mysql是服务名，根据你的服务名定）；
2.删除C:/Documents and Settings/All Users/Application Data/MySQL/MySQL Server 5.1/data目录下ib_logfile0、ib_logfile1两个文件删除，顺便说句，此目录下有个err文件，是以主机名命名的，里面记载着错误信息，类似下面这段：
InnoDB: The first specified data file E:/Data/ibdata1 did not exist:
InnoDB: a new database to be created!
090501 19:20:08 InnoDB: Setting file E:/Data/ibdata1 size to 10 MB
InnoDB: Database physically writes the file full: wait...
InnoDB: Error: log file ./ib_logfile0 is of different size 0 48234496 bytes
InnoDB: than specified in the .cnf file 0 17825792 bytes!
090501 19:20:09 [ERROR] Plugin 'InnoDB' init function returned error.
090501 19:20:09 [ERROR] Plugin 'InnoDB' registration as a STORAGE ENGINE failed.
090501 19:20:09 [ERROR] Unknown/unsupported table type: INNODB
090501 19:20:09 [ERROR] Aborting
090501 19:20:09 [Warning] Forcing shutdown of 1 plugins
090501 19:20:09 [Note] E:/Program Files/MySQL/MySQL Server/bin/mysqld: Shutdown complete
3.删除配置时指定的数据文件目录，好像当时我的不能立即删除，我用unlocker删除时它说要下次重启时删除。
4.重启。
5.启动配置工具配置。
这次就成功了。
感谢提供帮助信息的前辈们，也希望对出现同样错误的朋友有帮助。