自从BPR提出后，适应">供应链管理的组织结构变化逐渐从过去的注重功能集合转向注重过程或称流程的重构上来。传统组织改变的只是集权和分权的权重或是顾客，地区或产品之间的合作。而没有对基本工作流程进行重新设计。在新的环境下，功能一体化对企业获得优秀绩效的作用仍嫌不足，因为现在所在的经营环境和所依赖的信息技术都与几十年前大不一样，不彻底改变原有流程就不能实现新的目标。
70年代初，车间管理中的物流管理的重要性受到了进一步重视，出现了物流功能独立的组织形式，此时将物资配送和物料管理的功能独立出来，物流在企业中的地位也提高了。尤其是随着市场需求量逐渐加大，企业为了更快地，成本更低地做出反应，纷纷建立面向零售业的物流配送中心，这也是物流管理部门相对独立和地位提升的原因之一。
80年代初期，一体化物流组织的雏形出现了。这种组织结构试图在一个高层经理的领导下，统一所有的物流功能和运作，目的是对所有原材料和制成品的运输和存储进行战略管理，以使企业产品最大效益。这一时期计算机管理信息系统的发展，促进了一体化物流组织的形成。
在这种组织结构中，负责总体物流的计划部门与控制部门处在组织的最高层次上，这种组织结构的设置促进了一体化的形成。计划功能关注的是长期的战略定位，并对物流系统质量改进和重组负责。物流控制的注意力集中在成本和客户服务绩效的测量上，并为管理决策的制定提供信息。物流控制系统开发是综合物流管理的关键程序之一。这时的物流组织将厂商定位在可以处理采购，制造支持和物资配送之间的利益协调方面，有利于从整体把握全局观念。
实际上，这已经是供应链管理的基本形态了。一项综合研究显示，在过去的十年里，物流组织完成了从分割到物流一体化的转化，使功能渐趋整合。到90年代中期，物流组织中已包括联盟关系，并在可预见的未来保持优势。
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