在完成云计算平台的建设后，企业应考虑将业务应用逐步部署到云计算平台上。需要指出的是，将业务应用过渡到云计算平台上并不是一夜之间就可以实现的。事实上，不是每项业务应用都应该立刻列为迁移到云计算平台上的候选。从目前云计算的发展来看，不是每项业务应用在云计算平台上都能有很好的效果。例如，云计算平台对于一个工作负载在各个时间非常平均的应用来说，并不能体现出足够的优势。企业用户需要对应用进行评定，将这些业务应用逐步迁移到云计算平台。
另外，对于一个刚刚建好云计算平台的新手来说，采用哪种策略和配置来部署应用是一个更为重要、也更为棘手的问题。IDC建议，企业用户应更多的学习和观察云计算的成功案例，考察与自身应用类似的应用程序如何在云计算环境中运行，从而设计自身的应用部署策略。用户也可以寻找一些在云计算平台实施方面有较深经验的供应商作为合作伙伴，避免在应用部署时走弯路。
2010年，IDC在全国范围内对云计算平台上部署的IT应用情况也进行了调研，调研结果显示了国内云计算用户的应用部署情况，以及未来的部署计划。该结果可以为考虑应用部署优先级的企业提供参考。
IDC调研显示，最终用户目前部署在云计算平台上的应用与计划部署的应用还是有差异的。目前部署在云计算平台上的最多的五类应用依次为：业务应用（如财务、CRM、人力资源、ERP）、应用程序开发/测试/部署平台、高性能计算或科学技术（如设计、工程、研发）、商业智能/分析应用和Web应用程序/ Web服务。而未来三年中，会部署在云计算平台上最多的五类应用为：业务应用、Web应用程序/ Web服务、数据备份或存档服务、信息安全和IT管理和网络管理。
对比目前已部署的应用和未来的计划。我们会发现企业会将更多的应用在不久的将来迁移到云计算平台上。而无论是目前还是未来，最受关注的应用都是“业务应用”。目前有一些厂商也在提供基于CRM、ERP等的云服务，这也是最先被用户接受的部分。而未来，云计算平台上目前的一些应用会从开发、测试过渡到更关键的业务上，这也是随着云计算方面的技术水平逐渐走向成熟而必然导致的一种变化；同时，IaaS服务（数据备份或存档方面）也将会被更加广泛的采用。