基于Hadoop的化合物生物活性分析系统

基于Hadoop的化合物生物活性分析系统

李杰辉，张亮，陈健，南蓬

通过药物虚拟筛选，发现在具有生物活性化合物过程中，存在小分子结构相似性比较计算繁杂等问题。为此，结合MapReduce模型，提出一种基于Hadoop 的并行计算模型处理方法，并通过Hadoop 工具予以实现。同时根据Hadoop 分区算法不均匀、容错功能存在重复计算等问题对该方法进行改进。实验结果表明，该方法平均加速效率达到0.91，具有较好的可靠性和扩展性。

关键词：生物活性；生物信息学；并行计算；可扩展性；数据库；Hadoop 框架

temp_12071100048292.pdf