近日，着名开源专家、北大数学教授袁萌连续在CSDN个人博客上撰文，开始揭露国产COS操作系统的一些真相，指出上海联彤公司实际上并无实力">自主研发国产COS操作系统，因此被戴上国产“桂冠”的COS操作系统只能算是一个“杂种”操作系统，不能算作中国操作系统“梦”。
中科院软件所所长李明树曾公开表示，COS虽然吸取了开源软件的精华，但从底层代码到用户界面是完全独立演进的。就此，袁萌于2月14日开始在个人博客发表文章进行质疑，他称，从李明树的表述来看，“独立演进”就是所谓的“自主研发”，那么，什么叫“独立演进”？尤其是COS操作系统的“底层代码与用户界面”的演进？再者，既然坦率承认COS吸收了开源软件的“精华”（即Linux系统的程序代码），那么这种“独立演进”也不能算是“完全自主（研发）"的操作系统。因而，戴上国产“桂冠”的COS操作系统只能算是一个“杂种”操作系统，不是中国的操作系统“梦”。
依据何在？袁萌指出，上海联彤公司是中科院牵头，集IT产业、手机产业巨头为一体的大型企业，但公司却只有50到150人，这样的“大型企业”不太能够承担得了研发软件业的“大系统”。
而后，袁萌又在《再揭国产COS操作系统的内幕》博文中表示，上海联彤公司实际上是由李明树经过私下“交易”，赶忙到上海工商局登记注册拼装而成的公司。这般匆忙的原因是，COS项目立项要赶上十二五“核高基”立项。另外，由于上海联彤公司需要有个“国资控股”外壳，因此联彤便成了上海国资委控股、中科院软件所和威盛三家组成的合资企业。
然而联彤CEO是白逸民，他是由威盛电子指派，因此既是威盛电子董事长又是HTC董事长的王雪红就可以在幕后操纵联彤。袁萌称，这等于是王雪红通过拿出一点“小钱”，就把国家的“核高基”计划给“玩”了。
国产COS操作系统是Android吗？
针对此前有网友表示，国产COS操作系统与安卓一模一样，袁萌还就国产COS系统是不是Android进行了探究。
他在另外一篇博文中首先自问自答到，Android是Linux系统吗？正确回答是：Android是Linux操作系统，但是，不是GNU/Linux。Android操作系统有一个Linux内核，而其用户平台却不是GNU软件包，而是Dalvik软件包（所谓“Java虚拟机”），因而Android操作系统应该写作“Dalvik/Linux”。实际上，谷歌公司控制的就是Dalvik版本的升级授权，谷歌对系统Linux内核改动不算大。
再回到问题本身，国产COS系统采用了合作伙伴开发的“Java虚拟机”，这就是COS系统的用户平台，相当于谷歌的Dalvik虚拟机，由此可见，所谓国产COS操作系统实际上是类Android的一个系统，绝对不是“自主研发”的操作系统，因为COS操作系统最核心部分（即其用户平台）是上海联彤合作伙伴的，至于这个亲密伙伴是谁？有的人应该清楚。
另外，针对中科院软件所所长李明树和中科院软件所总体部主任武延军自主知识产权的言论，袁萌引入了一个很基本的问题进行探究：“Linux内核的开发总成本（TCO）是多少？”，根据《linux基金会》公布的一项研究报告来看，Linux内核的开发成本大约需要14亿美元（约合70亿人民币），对于一般的Linux发行版（即能实际运行的操作系统）而言，其开发成本大约需要100亿美元，这还只是2008年行情。所以，几乎不用什么成本，就能做出所谓的COS系统是中国自主知识产权的说法，是令人笑掉大牙的。
最后，袁萌还指出，由于世界知名法律专家Eben Moglen发起了《Software Freedon Law Center》专门对付违反GPL的行为，因此，冠名“中国”自主研发的操作系统肯定会给国家的诚信形象带来危害，其前途或许与“绿坝”软件相同。