今天的系统获取新的版本后部署时突然tomcat无法启动，而比较版本的变化内容，也就是几个jsp和js文件的变化，对于web.xml等都没有调整。
这个问题很是奇怪，下面把步骤总结一下，以避免类似的问题再次发生。
1 现象描述
已经发布的系统,IDE下运行正常，使用tomcat本身的startup.sh启动也正常
但是使用sudo start.sh 启动，日志中出现类似如下信息
StandardContext Start
Server: Error filterStart
造成系统无法进入
2 解决步骤
先使用关键字StandardContext Error filterStart进行搜索，可以看到很多人描述这个问题，但大都是以下2个大点：
v 配置问题
v JDK，Tomcat版本问题
而初步分析和如上的现象基本无关，因为如上的运行是在一个机器上，JDK和tomcat使用的是一个版本；配置肯定是对的，否则单独的startup.sh也不能正常启动了。
那现在初步定为为war的问题，因此把部署的目录删除，然后任意放入一个html页面，使用sudo startup.sh启动，页面可以正常访问，因此基本可以确定war的文件某些内容影响了系统的加载，但具体是哪个呢？
那接着查查sudo的这个差别在哪里，查阅google，可见sudo运行时的环境变量不一样，由此可以猜测，系统的库可能有一定的影响，使用ubuntu自动系统进程查看文件差别也没有遭到差别，经过多次的反复测试[消耗了无数的脑细胞]，突然想到，是否还是JDK的问题呢？因为系统的JDK升级过，从openjdk换成了oracle jdk，为了重现，只好把openjdk再清理一次，oracle jdk再安装一次，然后再启动，竟然好了。
原来还真是残留的某些文件对系统有影响，具体是哪个因为不好再次在线就没有再试了。
3 总结
sduo的差别问题具体总结：
http://stackoverflow.com/questions/15791488/different-environment-when-running-sudo-as-root
sudo removes LD_LIBRARY_PATH, LD_PRELOAD from the environment (I suspect it does it for root as well as ordinary users). This may cause different libraries to be loaded for the program.
sudo can be configured on what variables it resets/clears - see http://brandonhutchinson.com/wiki/Sudo_and_environment_variables
ubuntu的进程查看较弱，如果可以查看到加载的库文件等，估计可以较快的确定问题，不过没有接触到在Linux下像sysinternal的procmon procexp这样的强劲工具，现在专门查了一下，还真有些工具，可以作为以后的工具箱：
http://sourceforge.net/projects/procexp/
Graphical process explorer for Linux.
http://superuser.com/questions/285572/equivalent-to-sysinternals-process-explorer-on-linux
4 工具
对于出现类似问题的同学，专门写了一个jdk的安装和清理脚本，如果出现类似的问题时不妨一试。下面是具体的脚本：
OpenJDK卸载脚本
#openjdk6：tomcat运行消耗内存太大；Spirng IDE泄漏的问题，因此换为Oracle JDK
#如下是删除openjdk的方法
sudo dpkg -P openjdk-6-jdk
sudo apt-get remove openjdk-6-jdk
sudo apt-get remove openjdk-6-jre
sudo apt-get remove openjdk-6-jre-headless
sudo apt-get autoremove openjdk-6-jre-lib
#clear the config
dpkg -l |grep ^rc|awk '{print $2}'| sudo xargs dpkg -P
#old openjdk/openjre
if [ -d /usr/lib/jvm/java-6-openjdk ]; then
rm -r -f /usr/lib/jvm/java-6-openjdk
rm -f /usr/bin/java
rm -f /usr/bin/javac
fi
Oracle JDK的安装
#!/bin/bash
#old openjdk/openjre
#old is in:: /usr/lib/jvm/java-6-openjdk
#sudo dpkg -P openjdk-6-jdk
#sudo dpkg -P openjdk-6-jre
#sudo dpkg -P openjdk-6-jre-headless
#sudo dpkg -P openjdk-6-jre-lib
#ORACLE JDK
if [ -d /usr/lib/jvm/jdk1.7.0_25 ]; then
rm -r -f /usr/lib/jvm/jdk1.7.0_25
fi
mkdir -p /usr/lib/jvm
sudo tar -xzvf server-jre-7u25-linux-x64.tar.gz -C /usr/lib/jvm
echo 'Oracle JDK install ok'
#ENV
sudo echo 'export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/jdk1.7.0_25' >> /etc/profile
sudo echo 'export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH' >> /etc/profile
sudo echo 'export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib' >> /etc/profile
source /etc/profile
#set binary
sudo update-alternatives --install /usr/bin/java java /usr/lib/jvm/jdk1.7.0_25/bin/java 300
sudo update-alternatives --install /usr/bin/javac javac /usr/lib/jvm/jdk1.7.0_25/bin/javac 300
echo 'Oracle JDK env install ok'