这里前提是已经安装好了系统，IIS，包括FTP服务器，邮件服务器等，这些具体配置方法的就不再重复了，现在我们着重主要阐述下关于安全方面的配置。
关于常规的如安全的安装系统，设置和管理帐户，关闭多余的服务，审核策略，修改终端管理端口， 以及配置MS-SQL，删除危险的存储过程，用最低权限的public帐户连接等等，都不说了
先说关于系统的NTFS磁盘权限设置，大家可能看得都多了，但是2003服务器有些细节地方需要注意的，我看很多文章都没写完全。
C盘只给administrators 和system权限，其他的权限不给，其他的盘也可以这样设置，这里给的system权限也不一定需要给，只是由于某些第三方应用程序是以服务形式启动的，需要加上这个用户，否则造成启动不了。
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Windows目录要加上给users的默认权限，否则ASP和ASPX等应用程序就无法运行。以前有朋友单独设置Instsrv和temp等目录权限，其实没有这个必要的。
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另外在c:/Documents and Settings/这里相当重要，后面的目录里的权限根本不会继承从前的设置，如果仅仅只是设置了C盘给administrators权限，而在All Users/Application Data目录下会出现everyone用户有完全控制权限，这样入侵这可以跳转到这个目录，写入脚本或只文件，再结合其他漏洞来提升权限；譬如利用serv-u的本地溢出提升权限，或系统遗漏有补丁，数据库的弱点，甚至社会工程学等等N多方法，从前不是有牛人发飑说："只要给我一个webshell，我就能拿到 system"，这也的确是有可能的。在用做web/ftp服务器的系统里，建议是将这些目录都设置的锁死。其他每个盘的目录都按照这样设置，没个盘都只给adinistrators权限。
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另外，还将：net.exe，cmd.exe，tftp.exe，netstat.exe，regedit.exe，at.exe，attrib.exe，cacls.exe，这些文件都设置只允许administrators访问。
把不必要的服务都禁止掉，尽管这些不一定能被攻击者利用得上，但是按照安全规则和标准上来说，多余的东西就没必要开启，减少一份隐患。
在"网络连接"里，把不需要的协议和服务都删掉，这里只安装了基本的Internet协议（TCP/IP），由于要控制带宽流量服务，额外安装了 Qos数据包计划程序。在高级tcp/ip设置里--"NetBIOS"设置"禁用tcp/IP上的NetBIOS（S）"。在高级选项里，使用 "Internet连接防火墙"，这是windows 2003 自带的防火墙，在2000系统里没有的功能，虽然没什么功能，但可以屏蔽端口，这样已经基本达到了一个IPSec的功能。
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这里我们按照所需要的服务开放响应的端口。在2003系统里，不推荐用TCP/IP筛选里的端口过滤功能，譬如在使用FTP服务器的时候，如果仅仅只开放21端口，由于FTP协议的特殊性，在进行FTP传输的时候，由于FTP 特有的Port模式和Passive模式，在进行数据传输的时候，需要动态的打开高端口，所以在使用TCP/IP过滤的情况下，经常会出现连接上后无法列出目录和数据传输的问题。所以在2003系统上增加的windows连接防火墙能很好的解决这个问题，所以都不推荐使用网卡的TCP/IP过滤功能。
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